生物顯微鏡可廣泛用于生物學、細菌學、組織學、醫療、農牧業、紡織纖維、藥物化學等研究工作，在醫療中可進行臨床試驗，在學校實驗室可供教學之用。

光學顯微鏡的構造主要分為三部分：機械部分、照明部分和光學部分。

它的機械部分包括底座、鏡柱、鏡臂、鏡筒、物鏡轉換器、載物臺、調節器。

照明部分包括反光鏡、聚光鏡、光圈。

光學部分包括目鏡、物鏡。

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